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2021年10月，上海市科学技术委员会对市级工程技术研究中心进行了评估，上海稳定性同位素工程技术研究中心再次获得优秀。上海共有61家上海工程技术研究中心参与评估，经审定，9家工程技术研究中心评估结果为“优秀”；9家工程技术研究中心评估结果为“良好”；37家工程技术研究中心评估结果为“一般”；6家工程技术研究中心评估结果为“整改”。